Con decisione della Commissione del 6 ottobre 2020 è stata approvata, al fine di stimolare la ripresa del sistema produttivo del Paese, la proposta di riprogrammazione del PON Imprese e Competitività finalizzata a veicolare risorse del Programma a favore di interventi volti a contrastare la crisi sanitaria ed economica generata dal Covid-19. La riprogrammazione ha un impatto sulla dotazione finanziaria complessiva del Programma, che passa da 3,058 a 3,337 miliardi di euro.